Misi SMP Ma’arif 5 Metro ditetapkan sebagai representasi dari elemen visi dan elemen Profil pelajar Pancasila. Elemen Visi tersebut yaitu beriman, berakhlak Mulia, Cerdas, Mandiri, Berkebinekaan Global dan Berwawasan Lingkungan. Misi SMP Ma’arif 5 Metro adalah sebagai berikut :
1. Menciptakan peserta didik yang beriman dan berakhlakkul karimah
2. Membina membimbing kemandirian peserta didik melalui pembiasaan dan pengembangan diri
3. Meningkatkan mutu lulusan yang berkualitas dan berakhlak karimah
4. Melaksanakan pembelajaran yang aktif kreatif,inovatif dan menyenangkan
5. Melaksanakan pembelajaran dan bimbingan secara efektif dan efisien
6. Meningkatkan pengembangan pendidik dan tenaga kependidikan
7. Melaksanakan dan meningkatkan kegiatan keagamaan
8. Mengikuti berbagai perlombaan dengan segala jenjang (tingkatkan)